Zu den ältesten Museen Baden Württembergs zählt das 1870 gegründete Rosgarten Museum, welches im einstigen Zunfthaus der Metzgerinnung Quartier bezogen hat. Die Ausstellung informiert über Kunst, Kultur und Geschichte der Bodenseeregion von der Steinzeit bis in die Gegenwart. Weit zurück führt auch das Archäologische Museum im Stadtteil Petershausen. Die 1992 eröffnete Schausammlung in der einstigen Benediktinerabtei leistet einen wertvollen Beitrag zur Landesgeschichte. Nachdem in drei Räumen ein Einblick in die Arbeitsweise der Archäologen gegeben wurde, befassen sich verschiedene Themenräume mit der Geschichte der Schifffahrt, keltischen Gräberfeldern oder Bauten der Bronzezeit. Als Attraktion der Ausstellung gilt die Trossinger Leier aus dem 1. Jahrhundert. Der Lebensraum Bodensee wird im Bodensee Naturmuseum umfassend beleuchtet. Anschauliche Präsentationen verdeutlichen die Entstehung des Gewässers und stellen die am Bodensee heimische Tier- und Pflanzenwelt vor. Die Erlebnisausstellung “Steine am Fluss” gibt Gelegenheit, die Natur spielerisch zu erfahren. Das Hushaus macht mit Leben und Wirken des Reformators Jan Hus vertraut. Besucher erfahren in fünf Räumen anhand von Bildern und Dokumenten viel Wissenswertes über Jan Hus, welcher im Rahmen des Konstanzer Reformkonzils zum Tode verurteilt und am 6. Juli 1415 in Konstanz auf dem Scheiterhaufen verbrannt wurde.